Here is a list of all variables with links to the classes they belong to:

A

B

C

D

E

F

G

H

I

J

K

L

M

N

O

P

Q

R

S

T

U

V

W

X

Z

_

- b -

• backbone : vg::FlowSort::Growth
• background_sampler : vg::NGSSimulator
• backing : vg::BackTranslatingAlignmentEmitter, vg::SourceSinkOverlay, vg::SurjectingAlignmentEmitter
• backing_files : vg::HTSWriter
• backing_graph : vg::SnarlGraph, vg::SubgraphOverlay, vg::SubpathOverlay
• backing_heads : vg::SourceSinkOverlay
• backing_path_graph : vg::PathSubgraphOverlay
• backing_tails : vg::SourceSinkOverlay
• backward : vg::NodeTraversal
• bad_edit_index : vg::AlignmentValidity
• bad_mapping_index : vg::AlignmentValidity
• bad_read_position : vg::AlignmentValidity
• bad_subchains : vg::Recombinator::Statistics
• BADNESS_THRESHOLD : vg::Recombinator
• badness_threshold : vg::Recombinator::Parameters
• band_begin : vg::AlignmentChainModelVertex
• band_idx : vg::AlignmentChainModelVertex
• band_multimaps : vg::Mapper
• banded_matrices : vg::BandedGlobalAligner< IntType >
• banned_samples : vg::Recombinator::Parameters
• base : vg::WideningPRNG< PRNG, OutType >
• base_graph : vg::AugmentedGraph
• base_locks : vg::Packer
• base_md5_sum : vg::SequenceDictionaryEntry
• base_path_gref_counter : vg::GrefCover
• base_path_length : vg::SequenceDictionaryEntry
• base_path_name : vg::SequenceDictionaryEntry
• baseline_error_large : vg::PoissonSupportSnarlCaller
• baseline_error_small : vg::PoissonSupportSnarlCaller
• bases : vg::MinimizerMapper::aligner_stats_t
• bases_per_chunk : vg::Constructor
• batch_file_prefix : vg::HaplotypeIndexer
• batch_size : GiraffeMainOptions, vg::ReadFilter< Read >, vg::RebuildParameters
• begin : vg::algorithms::kmer_t, vg::algorithms::walk_t, vg::kmer_t, vg::MaximalExactMatch, vg::PathNode
• best_cyclic_snarl_exits : vg::ZipCodeTree::distance_iterator
• bga_middle : vg::MinimizerMapper::aligner_stats_t::stat_set_t
• BGZF_FOOTER_LENGTH : vg::HTSWriter
• bidirectional_gbwt : vg::GAFSorterFile, vg::GAFSorterParameters
• bidirectional_haplo_tx_gbwt : vg::IndexingParameters
• bin_size : vg::Packer
• bin_to_ranges : vg::StreamIndexBase
• bins_by_id_prefix : vg::StreamIndexBase
• bit_length : vg::BitString
• bits : vg::BitString
• border : vg::PhaseUnfolder
• border_offsets : vg::Exon
• border_steps : vg::Exon
• bottom : haplo::int_itvl_t
• bottom_diag : vg::BandedGlobalAligner< IntType >::BAMatrix
• bp_length : vg::PathPiece
• bp_offset : vg::PathPiece
• buffer : vg::ParallelKFFReader, vg::VcfBuffer, vg::zstd_ifstream, vg::zstd_ofstream
• BUFFER_SIZE : vg::GAFSorterParameters
• buffer_size : vg::GAFSorterParameters, vg::ReadFilter< Read >, vg::Recombinator::Parameters
• build : GBWTConfig
• BUILD_HOST : vg::Version
• build_jobs : GBWTConfig
• BUILD_USER : vg::Version
• builder : vg::RecombinatorHaplotype
• burn_in : vg::MCMCGenotyper
• by_id : vg::PathIndex
• by_start : vg::PathIndex